在密宗修行上，有三大根本是非常重要的：
壹、上師是一切加持的根本。
貳、本尊是一切成就的根本。
參、護法是一切事業的根本。
現在要慢慢約為各位講解清楚。
壹、上師是一切加持的根本：
在密教的修持理念中，應將上師視為本尊的化身 ，例如灌頂了聖如意輪觀世音菩薩的法 ，則應將上師視為聖如意輪觀世音菩薩的化身。自從釋迦佛涅槃後，其所遺留之經典、儀軌，若非有修證之成就者，往往會將經典之含意，做了錯誤的解釋，尤其是密宗的修持，有很多修行上的細節，在經文及儀軌中，通常沒有詳細的標示出來，如果自己沒有依止一位上師，很可能把修行次第或用功方法搞亂，最後便會產生種種問題，所以應視上師為本尊再世，或三世十方諸佛的化現，是人間、天上、地下無上的福田。因此， 恭敬上師是一切加持的根本。
而何謂「加持」呢？就是「能夠速獲成就之道」，由於上師悉心指導，傳授與護持，才能在成佛道上疾速相應，成就菩提道。因此，對上師不僅要起恭敬之心，並且要有絕對的信心。在密宗的理念上，弟子對上師、諸佛菩薩最佳的供養，為身、口、意清淨三業完全的供養，其中又以意供養最重要。當然，一個人要去信服別人，是很困難的，在凡夫地，每個人都有他的成見、思想、見解，所以要達到完全信賴一個人，把生死大事都交托給此人，這不是一般的信任，而是要非常非常的信任，如果要達到此目標，師徒之間一定要非常瞭解，而深刻的瞭解，則必須從幾方面去著手：
一、皈依師父前，最好先認識、觀察 一段時間：
在以前學習密宗必須先「上師觀察弟子三年，弟子也觀察師父三年」，最後師父認為此人堪為弟子，學者亦認為其堪為師者，二人心心相應，然後才舉行灌頂儀式，如此弟子對上師便能起絕對的信心與恭敬，才會毫無疑慮的依止上師的口訣、方法去修行。
二、皈依後，應常親近上師、道場：
已經皈依後，對上師即應深信不疑，而信任並非只是嘴巴說說，或是思想上強迫自己去接受，這是行不通的，最後將會產生反效果，而非從內心上，真正的去信服。此時，一方面必須與上師多多親近、接觸 ，從多方面瞭解上師；另一方面可將上師當作本尊之化現，所以頂禮上師時 ，若自己的貢高我慢心無法折服， 可以觀想自已是在向本尊頂禮， 而不是向上師的凡夫身頂禮， 慢慢的便可去除慢心了。
三、不要妄自臆測上師的作為：
修行過程中，上師亦是個人，故也要吃飯、睡覺、與凡人無異， 而在還沒有成佛前， 每個人皆有些許的習氣存在，所以初學者有時會對於上師的行為起疑心，而這點障礙 通常是較難突破的，因為上師的言行舉止與常人一樣，叫我們如何去信服呢？此即有待於觀念上之糾正，最好「不要把眼光放在上師的缺點上」，這是很重要的修持方法，應該認為「這是上師、本尊故意示現 ，用來激勵自己不要犯此錯誤的」。上師的做法，含有甚深涵義，不應妄自臆測。是不是在密教的思想中應該要把自己的上師「神化」呢？其實，將上師神化，並不是密教最重要的思想，最重要的是指導你的人，在你內心中，如果不是個絕對清淨，跟佛無異的人，那你的恭敬心將產生不了，以致無法完全接受其教法，這影響到你日後成就，故寧可在你內心中，建立起上師最完美的形象。所以，每個人的上師，可能都完全不一樣，因為心有高下，故上師亦有高下，對於你感應、加持及口訣接受程度當然也有所高下。 而你無法具足清淨心，可能就像一個桶子。底下漏了一個洞，洞口愈大，要把桶子的水裝滿，時間可能愈久，最好是沒有洞口，才可以完全的的承受，疾速成就。這裡又牽涉到上師所做的心意，或做此事的用意，可能事過境遷，一段時日以後，才會恍然大悟，誠如密勒日巴尊者因學了惡法，誅殺很多人，後來知道自己造了很重的罪業 ，便去請求馬爾巴上師傳授無上密法，消除罪障，於是馬爾巴上師就百般折磨他，只叫他做苦工，而不教他修法如同多了一個很有用的奴隸一般 ，時常叫他從山下搬石頭，到山上蓋石屋，等到快蓋好了，就叫他拆掉，甚至拳打腳踢一番，最後背部都長瘡了。如果妳不是具足了信心，不是真的很想去追求佛法的人，若遇到像尊者這樣的遭遇，可能早就退心，而且會認為這個上師不是有神經病，就是有虐待狂了。目前，在人世間，任何時代皆一樣，弟子對上師的做法，並不一定瞭解，或上師日常對話間，會隱隱的透露出一些玄機，你本身沒有留意的去體會，由於妳以一種世俗人的角度去看你的上師，便會產生很多問題，那是因為妳用妳本身做標準，用你本身的道德觀念、思想、行為、價值觀去衡量妳的上師，當然你就沒有辦法對你的上師產生恭敬，因為妳是用凡夫心去揣測。或許妳的上師處理事情真的犯了錯，由於你把它當成是上師對你的指導和啟示，從而產生了恭敬心，然後更加謹慎、警惕、與其得到一個壞印象，還不如得到一個好印象 ，對你會較有幫助的。====>